Para peneliti baru-baru ini membuat terobosan dalam memahami evolusi tumor pada kanker ovarium serosa tingkat tinggi (HGSOC) melalui teknologi sequencing Oxford Nanopore. Penelitian ini memberikan wawasan baru tentang peran variasi struktural (SV) dalam perkembangan kanker dan dampaknya terhadap pengobatan pasien.
Heterogenitas Tumor sebagai Tantangan Utama
HGSOC memiliki tingkat heterogenitas yang tinggi. Hal ini menjadi faktor utama dalam kekambuhan dan resistensi terhadap pengobatan. Oleh karena itu, variasi antar tumor membuat terapi seragam kurang efektif. Dengan demikian, temuan ini menyoroti pentingnya analisis mendalam untuk memahami perbedaan genetik antar individu.
Analisis Tumor Primer dan Rekuren
Dalam studi yang melibatkan 32 pasien, para peneliti menganalisis tumor primer dan rekuren. Hasilnya menunjukkan bahwa profil mutasi somatik tetap stabil sepanjang perkembangan penyakit. Oleh sebab itu, perubahan genetik awal memiliki pengaruh lebih besar dibandingkan perubahan akibat pengobatan.
Resistensi Kemoterapi dari Klon Tumor yang Ada
Salah satu temuan penting dari penelitian ini adalah bahwa resistensi terhadap kemoterapi berasal dari klon tumor yang sudah ada sebelumnya. Bukan dari mutasi baru akibat pengobatan. Dengan kata lain, strategi pengobatan yang lebih efektif harus mempertimbangkan klon ini sejak awal terapi.
Teknologi Pembacaan Ultra-Panjang
Oxford Nanopore memungkinkan pembacaan ultra-panjang yang mampu mengidentifikasi variasi struktural. Teknik ini juga menemukan insersi besar, delesi, dan perubahan genetik kompleks yang berkontribusi pada evolusi tumor. Selain itu, metode ini mampu mendeteksi SV yang sulit ditemukan dengan teknik sequencing lainnya.
Identifikasi Subtipe Tumor
Analisis lebih lanjut mengungkapkan tiga subtipe tumor berdasarkan variasi struktural. Dengan demikian, subtipe ini berpotensi menjadi biomarker baru untuk pengobatan bertarget di masa depan. Hal ini membuka peluang untuk terapi yang lebih personal dan efektif.
Secara keseluruhan, temuan ini menegaskan pentingnya pengobatan kanker yang dipersonalisasi. Terapi perlu disesuaikan dengan profil genetik individu. Dengan pemahaman lebih dalam tentang variasi struktural dan evolusi tumor, pendekatan ini diharapkan mampu meningkatkan efektivitas pengobatan serta mengurangi risiko kekambuhan pada pasien HGSOC.
Oleh karena itu, penelitian ini membuka babak baru dalam pengobatan kanker ovarium. Teknologi sequencing Oxford Nanopore menjadi alat penting dalam meningkatkan hasil klinis dan kualitas hidup pasien.
Referensi: Diaz, M. et al. (2025). The mutation and clonality profile of genomically unstable high grade serous ovarian cancer is established early in tumor development and conserved throughout therapy resistance. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2025.02.14.638365
