Mikrobioma udara dan keragamannya sangat penting untuk jadi pengetahuan yang bermanfaat bagi kesehatan manusia dan ketahanan ekosistem. Namun saat ini pemantauan menyeluruh terhadap keberagaman mikroba udara masih relatif sedikit penelitiannya. Hal ini menunjukkan sedikitnya pengetahuan komposisi, distribusi, atau efek fungsional mikrobioma udara.
Penelitian dalam jurnal ini berhasil menunjukkan bahwa shotgun nanopore sekuensing dapat secara kuat menganalisis mikrobioma udara. Metodenya melibatkan pengambilan sampel udara secara aktif melalui penyapuan cairan (active air sampling through liquid impingement) dan lanjut analisis komputasional. Pendekatan ini membuktikan keefektifannya dalam eksplorasi komposisi mikrobioma udara dengan hasil yang signifikan. Jurnal ini menyajikan protokol laboratorium dan komputasi untuk profil mikrobioma udara, dan dengan andal menganalisis komposisi taksonomi dari sample mikrobioma udara di lingkungan terkontrol maupun alami.
Berdasarkan hasil long read sekuensing de novo assembly. Penelitian dalam jurnal ini berhasil mengidentifikasi taksa dari beberapa mikrobiota udara hingga tingkat spesies. Penemuan ini memberikan wawasan mendalam mengenai keberagaman mikroorganisme di udara. Selain itu, penelitian juga sukses mengannotasikan fungsi ekosistem mereka, termasuk peran potensial dalam proses biodegradasi alami. Dengan kemampuan pemantauan udara menggunakan sekuensing nanopore yang pengaplikasiannya dapat secara otomatis, cepat, dan portabel untuk aplikasi di seluruh dunia. Peneliti membayangkan bahwa pendekatan ini sangat berpotensi dalam membantu menjelajahi secara menyeluruh peran mikrobioma udara.
Sampling Udara Secara Efektif dengan Coriolis Micro Air Sampler
Untuk menunjang aplikasi nanopore sequensing dalam pemantauan mikrobioma udara. ADVISAINS menyediakan solusi sampling udara aktif secara efektif menggunakan metode penyapuan cairan oleh Coriolis Mircro.
Gambar 1: Coriolis-Micro-–-Microbial-Air-Sampler
Coriolis Micro, alat pengambil sampel udara biologis portabel yang menjadi standar untuk menguji kualitas udara, baik di dalam ruangan maupun di luar ruangan. Air sampler ini hanya membutuhkan waktu 10 menit untuk mengumpulkan partikel udara menggunakan teknologi sikloniknya yang terintegrasi dengan laju hisap tinggi, sehingga pengambilan sample udara biologis dapat lebih efisien. Sample mikrobioma udara di tangkap menggunakan penyapuan cairan dan menghasilkan sampel dalam fase cair.
Baca Juga: Oligo: Senjata Molekuler dalam Penelitian Modern
Tidak hanya meningkatkan efisiensi pengambilan sample udara. Dengan teknologinya yang mutahkir, Coriolis juga dapat mendeteksi virus dalam sampel udara. Meskipun pengambilan aerosol terkontaminasi virus memiliki banyak tantangan, Coriolis Micro mampu mengatasi hal tersebut dengan menggunakan laju alir tinggi hingga 300L/menit. Dengan kemampuan ini, alat ini dapat mengumpulkan sampel udara untuk deteksi virus udara dalam beberapa jam, bahkan pada konsentrasi virus yang sangat rendah (100 copy genome/m3).
Melalui teknologi siklonik cairannya yang unik, ia dapat mengumpulkan partikel virus dalam cairan koleksi yang dipilih. Sampel Coriolis Micro kompatibel dengan semua teknik mikrobiologi cepat seperti qPCR atau mikroarray, dan juga analisis NGS.
Keunggulan Coriolis Micro Air Sampler: Portable, Stabil, dan Efisien dalam Pengambilan Sampel Udara
Coriolis micro air sampler telah didesain sedemikian rupa untuk memudahkan user dalam menggunakannnya di beberapa titik atau tempat yang berbeda. Ukurannya yang compact (2.8 kg) menjadikan alat ini sangat portable dan sangat stabil digunakan.
Waktu pengambilan sampel dapat bervariasi dari hanya beberapa menit karena aliran udara tinggi (100 hingga 300 L/menit) hingga lebih dari 6 jam untuk pemantauan udara yang lebih lama. Dengan Coriolis Micro, analisis biokontaminasi dan pengambilan sampel virologis di lingkungan medis atau kesehatan dapat dilakukan dalam beberapa jam saja. Alat ini memberikan kemudahan dan efisiensi dalam berbagai aplikasi terkait kesehatan dan keamanan biologis. Alat ini juga memungkinkan pengendalian polusi lingkungan secara langsung di lapangan dengan efisiensi yang sama. Aplikasi dari kecanggihan teknologi yang ditawarkan pada coriolis micro air sample sangat bermanfaat dalam industri farmasi, agro-pangan, dan veteriner, serta dalam penelitian dan pengembangan microbioma udara.
Advisains dapat memfasilitasi diskusi lebih lanjut mengenai product ONT and Bertin. Sampaikan Kebutuhan Riset Anda Tim advisor spesialis kami sangat antusias mendukung keberhasilan riset dan aplikasi rutin Anda. Chat sekarang (+62 817 9154 607/info@advisains.id).
Referensi:
- Air monitoring by nanopore sequencing https://doi.org/10.1101/2023.12.19.572325
