Bioteknologi

Ecoplate Biolog: Profiling Komunitas Mikroba dan Cara Menggunakannya

Penggunaan mikrobiologi dalam studi lingkungan semakin berkembang dengan adanya alat dan metode canggih yang memungkinkan analisis mendalam terhadap komunitas mikroba. Salah satu alat yang sering digunakan untuk menganalisis aktivitas metabolik komunitas mikroba adalah Ecoplate Biolog. Alat ini menawarkan pendekatan yang sensitif dan dapat diandalkan untuk mengidentifikasi perubahan lingkungan melalui aktivitas komunitas mikroba, terutama dengan metode Community-Level Physiological Profiling (CLPP).

Gambar 1: Ecoplate Biolog

Aplikasi Ecoplate Biolog

Ecoplate Biolog memiliki berbagai aplikasi dalam berbagai bidang ekologi dan mikrobiologi. Alat ini sering digunakan untuk memahami aktivitas komunitas mikroba pada tingkat metabolik dan untuk mengamati perubahan populasi mikroba dalam lingkungan. Berikut beberapa aplikasi utama dari alat ini:

  • Menganalisis Perubahan Populasi Mikroba di Tanah
  • Profiling Air dan Air Limbah
  • Pengujian Lumpur Aktif, Kompos, dan Limbah Industri
  • Memantau Bioremediasi dan Efek Bahan Kimia Beracun

Metode Ecoplate Biolog

Ecoplate Biolog menggunakan metode Community-Level Physiological Profiling (CLPP) untuk mengukur aktivitas mikroba berdasarkan pola pemanfaatan sumber karbon. Setiap pelat mikro Ecoplate memiliki 31 sumber karbon yang berbeda, dan mikroba dari sampel lingkungan diinokulasikan ke dalam pelat tersebut. Jika mikroba dapat menggunakan sumber karbon tertentu, mereka akan menghasilkan reaksi metabolik yang mengubah warna indikator, sehingga aktivitas mikroba dapat diukur secara visual atau dengan alat pembaca khusus.

Beberapa metode spesifik yang digunakan dalam analisis dengan Ecoplate Biolog adalah:

  • Metabolic Community Fingerprinting: Menghasilkan “sidik jari” metabolik yang unik untuk komunitas mikroba, sehingga dapat diketahui perbedaan dalam pola pemanfaatan karbon antara satu komunitas dengan yang lain.
  • Assaying Carbon Source Utilization Patterns (CSUP): Menganalisis pola pemanfaatan sumber karbon untuk mengetahui tingkat keanekaragaman metabolik dan fungsionalitas komunitas mikroba.

Instrumen yang Digunakan untuk Microplate Biolog

Untuk membaca dan menganalisis hasil dari Microplate, termasuk Ecoplate, diperlukan instrumen khusus dari Biolog yaitu MicroStations dan ODiN. Biolog sendiri merekomendasikan instrument MicroStation dari Biolog. MicroStation adalah sistem yang dirancang untuk mengukur perubahan warna pada wells pelat mikro secara otomatis. Instrumen ini membaca absorbansi pada panjang gelombang yang sesuai dan memberikan data yang dapat dianalisis lebih lanjut. MicroStation cocok untuk laboratorium yang membutuhkan throughput sedang dan memungkinkan pengguna untuk mendapatkan hasil yang cepat dan akurat.

Gambar 2 Instrumen Biolog: MicroStation & ODiN

Kedua instrumen di atas penting dalam mengoptimalkan penggunaan Microplate, termasuk Ecoplate, dengan menyediakan hasil yang lebih akurat dan efisien dibandingkan metode manual. Lalu, apakah Ecoplate Biolog dapat digunakan tanpa Instrumen di atas?

Penggunaan Ecoplate Biolog Tanpa Instrumen Biolog

Meskipun biasanya digunakan dengan instrumen khusus seperti MicroStation, alat ini juga dapat digunakan secara manual tanpa instrumen tersebut. Berikut adalah beberapa syarat yang harus dipenuhi jika Ecoplate Biolog digunakan tanpa instrumen khusus dari Biolog:

  • Spektrofotometer atau Pembaca Pelat Mikro

Untuk mengukur absorbansi atau perubahan warna pada Ecoplate Biolog, diperlukan spektrofotometer atau pembaca pelat mikro yang dapat mengukur panjang gelombang yang sesuai (biasanya sekitar 590 nm). Alat ini digunakan untuk mengukur tingkat perubahan warna secara kuantitatif.

  • Pengamatan Visual

Jika spektrofotometer tidak tersedia, pengguna dapat melakukan pengamatan visual untuk melihat perubahan warna pada wells Ecoplate. Meskipun ini kurang akurat dibandingkan dengan pengukuran otomatis, perubahan warna yang jelas dapat tetap menunjukkan aktivitas metabolik komunitas mikroba.

  • Pencatatan dan Interpretasi Manual

Penggunaan tanpa instrumen khusus mengharuskan pengguna untuk mencatat hasil secara manual dan dengan hati-hati. Pengguna harus konsisten dalam mencatat intensitas perubahan warna dan mengikuti prosedur protokol untuk memastikan hasil yang dapat diandalkan.

Ecoplate Biolog menawarkan alat yang efektif untuk mempelajari dinamika komunitas mikroba dalam berbagai aplikasi lingkungan. Dengan kemampuannya dalam mendeteksi perubahan aktivitas mikroba melalui Community-Level Physiological Profiling (CLPP), alat ini dapat digunakan untuk memantau berbagai aspek ekologi mikroba, mulai dari bioremediasi hingga profiling air limbah.

 

Instrumen utama yang digunakan untuk membaca dan menganalisis hasil dari Ecoplate adalah MicroStation dan ODiN. KeduacInstrumen ini memberikan hasil yang cepat dan akurat dengan pengukuran otomatis. Namun, jika instrumen ini tidak tersedia, masih dapat digunakan secara manual, dengan syarat pengamatan visual yang teliti dan penggunaan spektrofotometer untuk hasil yang lebih akurat.


Advisains dapat memfasilitasi diskusi lebih lanjut mengenai Ecoplate | Biolog. Sampaikan Kebutuhan Riset Anda Tim advisor spesialis kami sangat antusias mendukung keberhasilan riset dan aplikasi rutin Anda. Maka, jangan ragu untuk chat sekarang (+62 817 9154 607/info@advisains.id).

Baca juga:
Tahapan Lengkap Workflow Next Generation Sequencing (NGS)

Tinggalkan Balasan

Alamat email Anda tidak akan dipublikasikan. Ruas yang wajib ditandai *